Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Ilf3Q9Z1X4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ilf3Q9Z1X4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms