Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgr5Q9Z1P4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Lgr5Q9Z1P4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgr5Q9Z1P4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms