Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms