Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam50bQ9WTJ8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms