Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gpc6Q9R087 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms