Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col4a3Q9QZS0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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