Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Col4a4Q9QZR9 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Col4a4Q9QZR9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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