Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnnt3Q9QZ47 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms