Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mkrn1Q9QXP6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mkrn1Q9QXP6 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mkrn1Q9QXP6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mkrn1Q9QXP6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mkrn1Q9QXP6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mkrn1Q9QXP6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn1Q9QXP6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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