Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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