Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rabgef1Q9JM13 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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