Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Nectin3Q9JLB9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1240.2 ms