Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole3Q9JKP7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pole3Q9JKP7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms