Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Scamp5Q9JKD3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Scamp5Q9JKD3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms