Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
SelenofQ9ERR7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms