Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trim54Q9ERP3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trim54Q9ERP3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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