Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms