Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Erp27Q9D8U3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Erp27Q9D8U3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Erp27Q9D8U3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Erp27Q9D8U3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Erp27Q9D8U3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms