Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Capns2Q9D7J7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Capns2Q9D7J7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Capns2Q9D7J7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Capns2Q9D7J7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Capns2Q9D7J7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Capns2Q9D7J7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Capns2Q9D7J7 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Capns2Q9D7J7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Capns2Q9D7J7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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