Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms