Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Snx29Q9D3S3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snx29Q9D3S3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snx29Q9D3S3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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