Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Trappc6bQ9D289 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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