Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snu13Q9D0T1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snu13Q9D0T1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms