Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYT6

Cap2, Adenylyl cyclase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap2Q9CYT6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cap2Q9CYT6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms