Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Sgo1Q9CXH7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sgo1Q9CXH7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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