Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Utp23Q9CX11 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Utp23Q9CX11 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms