Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot11Q9CWN7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms