Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Smurf1Q9CUN6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Smurf1Q9CUN6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Smurf1Q9CUN6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smurf1Q9CUN6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms