Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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