Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Atg12Q9CQY1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms