Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Nudt21Q9CQF3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms