Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Atp6v0e1Q9CQD8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Atp6v0e1Q9CQD8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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