Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atp1b4Q99ME6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms