Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gins4Q99LZ3 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gins4Q99LZ3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms