Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nmd3Q99L48 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nmd3Q99L48 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nmd3Q99L48 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nmd3Q99L48 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nmd3Q99L48 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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