Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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