Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klc3Q91W40 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Klc3Q91W40 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms