Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc115Q8VE99 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc115Q8VE99 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc115Q8VE99 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccdc115Q8VE99 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccdc115Q8VE99 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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