Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Smg8Q8VE18 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smg8Q8VE18 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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