Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OptnQ8K3K8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms