Protein–RNA interactions for Protein: Q8K349

Gimap6, GTPase IMAP family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimap6Q8K349 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gimap6Q8K349 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms