Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Phf13Q8K2W6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms