Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LgsnQ8CIX8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LgsnQ8CIX8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LgsnQ8CIX8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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