Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SbsnQ8CIT9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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