Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Upp2Q8CGR7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.4 ms