Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms