Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rdh13Q8CEE7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rdh13Q8CEE7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rdh13Q8CEE7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rdh13Q8CEE7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rdh13Q8CEE7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rdh13Q8CEE7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms