Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pramef8Q8CE24 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms