Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atg4aQ8C9S8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg4aQ8C9S8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg4aQ8C9S8 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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