Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc113Q8C5T8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms